通常锈黄发生的成因可从三方面探讨，石材加工过程中处理不当所产生的锈黄；安装后配件生锈之污染；原始材料本身含不稳定铁矿物。
1、石材加工过程中处理不当所产生的锈黄：原石以钢砂拉锯加工切割时，石材表面可能因残余钢砂未清洗干净，水汽作用后，形成锈斑。一般而言，石材经研磨抛光后，锈斑的情形通常不会再发生。石材经切割后酸洗，残留酸物质造成石材含铁矿物加速氧化所致。
2、安装后配件生锈之污染：石材以湿式加强法或干式工法安装时，其铁配件生锈而扩散至石材表面形成锈黄。由于造成锈黄的因素，是因为石材本身含有不稳定的含铁矿物，或是外来的铁锈因为水分而渗透至石材表面造成锈黄。
3、原始材料本身含不稳定铁矿物：绝大部分大理石以及花岗岩内部多存在有含铁矿物，如碳酸铁、硫化铁、铁硅酸盐矿物等，长期在酸与水的作用下，亦可能发生氧化生锈而成褐铁矿(Fe2O3、nH2O)，污染石材形成锈黄，甚至因生锈后体积膨胀而层层剥落，因而在石材形成锈黄，甚至因生锈后体积膨胀而层层剥落，因而在石材表面形成小坑洞。
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